HPVomics

A therapeutic and epitome resource for Human Papillomaviruses

Predicted highly potential siRNAs (HR-HPVs)



S.No. HPV type HPV target region Start position End position Sense Antisense Inhibition (%) Off-target (seed)
1 HPV16 E1 100 118 tcagatgacgagaacgaaa tttcgttctcgtcatctga 79.53 49
2 HPV16 E1 925 943 cctccaaaattgcgtagta tactacgcaattttggagg 76.39 16
3 HPV16 E1 1224 1242 gtgtagacattataaacga tcgtttataatgtctacac 76.11 19
4 HPV16 E1 1081 1099 gtacaatgggcctacgata tatcgtaggcccattgtac 74.11 19
5 HPV16 E1 194 212 agacagcacatgcgttgtt aacaacgcatgtgctgtct 73.68 9
6 HPV16 E1 462 480 aacaccatgtagtcagtat atactgactacatggtgtt 72.7 46
7 HPV16 E1 262 280 cgaaagtatttgggtagtc gactacccaaatactttcg 71.02 25
8 HPV16 E1 372 390 gagattatttgaaagcgaa ttcgctttcaaataatctc 70.79 30
9 HPV16 E1 1082 1100 tacaatgggcctacgataa ttatcgtaggcccattgta 70.57 11
10 HPV16 E1 1853 1871 ccagattaagtttgcacga tcgtgcaaacttaatctgg 70.29 19
11 HPV16 E1 373 391 agattatttgaaagcgaag cttcgctttcaaataatct 70.19 33
12 HPV16 E1 371 389 ggagattatttgaaagcga tcgctttcaaataatctcc 69.39 33
13 HPV16 E1 922 940 gagcctccaaaattgcgta tacgcaattttggaggctc 69.23 7
14 HPV16 E1 1855 1873 agattaagtttgcacgagg cctcgtgcaaacttaatct 69.22 35
15 HPV16 E1 1103 1121 acatagtagacgatagtga tcactatcgtctactatgt 68.55 50
16 HPV16 E1 1649 1667 agcatagaccattggtaca tgtaccaatggtctatgct 68.21 41
17 HPV16 E1 26 44 gggaagagggtacgggatg catcccgtaccctcttccc 67.29 15
18 HPV16 E1 306 324 agacaataatattagtcct aggactaatattattgtct 66.53 46
19 HPV16 E1 195 213 gacagcacatgcgttgttt aaacaacgcatgtgctgtc 66.11 11
20 HPV16 E1 1101 1119 tgacatagtagacgatagt actatcgtctactatgtca 63.24 5
21 HPV16 E1 921 939 agagcctccaaaattgcgt acgcaattttggaggctct 62.77 12
22 HPV16 E1 1641 1659 ggatgtaaagcatagacca tggtctatgctttacatcc 60.92 41
23 HPV16 E1 1898 1916 actctttgccaacgtttaa ttaaacgttggcaaagagt 60.39 35
24 HPV16 E1 27 45 ggaagagggtacgggatgt acatcccgtaccctcttcc 60 47
25 HPV16 E1 1652 1670 atagaccattggtacaact agttgtaccaatggtctat 59.23 31
26 HPV16 E1 927 945 tccaaaattgcgtagtaca tgtactacgcaattttgga 59.11 20
27 HPV16 E1 688 706 aaatcaacgtgttgcgatt aatcgcaacacgttgattt 58.45 11
28 HPV16 E1 1098 1116 taatgacatagtagacgat atcgtctactatgtcatta 58.14 8
29 HPV16 E1 1423 1441 ctatatggtgcagctaaca tgttagctgcaccatatag 57.92 47
30 HPV16 E1 923 941 agcctccaaaattgcgtag ctacgcaattttggaggct 57.84 13
31 HPV16 E1 233 251 aacatagagatgcagtaca tgtactgcatctctatgtt 57.74 42
32 HPV16 E1 33 51 gggtacgggatgtaatgga tccattacatcccgtaccc 57.64 50
33 HPV16 E1 388 406 gaagacagcgggtatggca tgccatacccgctgtcttc 57.35 31
34 HPV16 E1 296 314 gtggatgtgtagacaataa ttattgtctacacatccac 56.54 47
35 HPV16 E1 994 1012 gtgtatggagacacgccag ctggcgtgtctccatacac 56.48 40
36 HPV16 E1 1229 1247 gacattataaacgagcaga tctgctcgtttataatgtc 56.29 34
37 HPV16 E1 992 1010 aagtgtatggagacacgcc ggcgtgtctccatacactt 56.16 17
38 HPV16 E1 991 1009 gaagtgtatggagacacgc gcgtgtctccatacacttc 55.95 37
39 HPV16 E1 374 392 gattatttgaaagcgaaga tcttcgctttcaaataatc 55.89 17
40 HPV16 E1 193 211 gagacagcacatgcgttgt acaacgcatgtgctgtctc 55.65 28
41 HPV16 E1 1097 1115 ataatgacatagtagacga tcgtctactatgtcattat 55.62 9
42 HPV16 E1 718 736 gcatttggacttacaccca tgggtgtaagtccaaatgc 55.52 35
43 HPV16 E1 263 281 gaaagtatttgggtagtcc ggactacccaaatactttc 54.7 37
44 HPV16 E1 101 119 cagatgacgagaacgaaaa ttttcgttctcgtcatctg 54.6 34
45 HPV16 E1 926 944 ctccaaaattgcgtagtac gtactacgcaattttggag 54.55 16
46 HPV16 E1 1080 1098 ggtacaatgggcctacgat atcgtaggcccattgtacc 54.23 7
47 HPV16 E1 1143 1161 attggcagacactaatagt actattagtgtctgccaat 54.22 39
48 HPV16 E1 1084 1102 caatgggcctacgataatg cattatcgtaggcccattg 54.1 16
49 HPV16 E1 102 120 agatgacgagaacgaaaat attttcgttctcgtcatct 54.07 31
50 HPV16 E1 1854 1872 cagattaagtttgcacgag ctcgtgcaaacttaatctg 53.96 27
51 HPV16 E1 1895 1913 gagactctttgccaacgtt aacgttggcaaagagtctc 53.86 40
52 HPV16 E1 1083 1101 acaatgggcctacgataat attatcgtaggcccattgt 53.71 5
53 HPV16 E1 98 116 tatcagatgacgagaacga tcgttctcgtcatctgata 53.17 44
54 HPV16 E1 468 486 atgtagtcagtatagtggt accactatactgactacat 53.08 48
55 HPV16 E1 97 115 atatcagatgacgagaacg cgttctcgtcatctgatat 53.03 35
56 HPV16 E1 993 1011 agtgtatggagacacgcca tggcgtgtctccatacact 53.02 42
57 HPV16 E1 995 1013 tgtatggagacacgccaga tctggcgtgtctccataca 53 34
58 HPV16 E1 1582 1600 tgttggaactacatagatg catctatgtagttccaaca 52.95 50
59 HPV16 E1 1642 1660 gatgtaaagcatagaccat atggtctatgctttacatc 52.89 47
60 HPV16 E1 1226 1244 gtagacattataaacgagc gctcgtttataatgtctac 52.73 38
61 HPV16 E1 99 117 atcagatgacgagaacgaa ttcgttctcgtcatctgat 52.59 40
62 HPV16 E1 996 1014 gtatggagacacgccagaa ttctggcgtgtctccatac 52.53 32
63 HPV16 E1 495 513 gggtggttgcagtcagtac gtactgactgcaaccaccc 52.35 46
64 HPV16 E1 1227 1245 tagacattataaacgagca tgctcgtttataatgtcta 52.28 13
65 HPV16 E1 1771 1789 gagtttccatttgacgaaa tttcgtcaaatggaaactc 51.78 24
66 HPV16 E1 4 22 gctgatcctgcaggtacca tggtacctgcaggatcagc 51.75 35
67 HPV16 E1 1770 1788 tgagtttccatttgacgaa ttcgtcaaatggaaactca 51.75 7
68 HPV16 E1 726 744 acttacacccagtatagct agctatactgggtgtaagt 51.69 48
69 HPV16 E1 1711 1729 ggtacagattctaggtggc gccacctagaatctgtacc 51.49 34
70 HPV16 E1 1894 1912 ggagactctttgccaacgt acgttggcaaagagtctcc 51.42 19
71 HPV16 E1 376 394 ttatttgaaagcgaagaca tgtcttcgctttcaaataa 51.28 21
72 HPV16 E1 25 43 ggggaagagggtacgggat atcccgtaccctcttcccc 51.24 10
73 HPV16 E1 1102 1120 gacatagtagacgatagtg cactatcgtctactatgtc 51.23 2
74 HPV16 E1 1077 1095 gatggtacaatgggcctac gtaggcccattgtaccatc 50.99 28
75 HPV16 E1 1079 1097 tggtacaatgggcctacga tcgtaggcccattgtacca 50.97 14
76 HPV16 E1 1099 1117 aatgacatagtagacgata tatcgtctactatgtcatt 50.93 11
77 HPV16 E1 1897 1915 gactctttgccaacgttta taaacgttggcaaagagtc 50.87 26
78 HPV16 E1 1639 1657 atggatgtaaagcatagac gtctatgctttacatccat 50.64 39
79 HPV16 E1 1228 1246 agacattataaacgagcag ctgctcgtttataatgtct 50.51 22
80 HPV16 E1 1074 1092 acagatggtacaatgggcc ggcccattgtaccatctgt 50.47 50
81 HPV16 E1 814 832 ggaatggttgtgttactat atagtaacacaaccattcc 50.11 49
82 HPV16 E1 1640 1658 tggatgtaaagcatagacc ggtctatgctttacatcca 50.03 35
83 HPV31 E1 1164 1182 gtgtagacattataaacga tcgtttataatgtctacac 76.11 19
84 HPV31 E1 404 422 atactgaagtggaaacgca tgcgtttccacttcagtat 63.37 33
85 HPV31 E1 1661 1679 acagatggccatacctaca tgtaggtatggccatctgt 62.03 46
86 HPV31 E1 1503 1521 agatgatgctacaacgcca tggcgttgtagcatcatct 58.75 26
87 HPV31 E1 1793 1811 gcagattaaatttgcacga tcgtgcaaatttaatctgc 58.2 19
88 HPV31 E1 1365 1383 acatggtgcacctaataca tgtattaggtgcaccatgt 58.12 40
89 HPV31 E1 407 425 ctgaagtggaaacgcagca tgctgcgtttccacttcag 57.36 28
90 HPV31 E1 1169 1187 gacattataaacgagcaga tctgctcgtttataatgtc 56.29 34
91 HPV31 E1 1795 1813 agattaaatttgcacgagg cctcgtgcaaatttaatct 56.15 35
92 HPV31 E1 1544 1562 acctacgaaatgcactaga tctagtgcatttcgtaggt 55.99 43
93 HPV31 E1 463 481 tgtaatggtagtgacggga tcccgtcactaccattaca 55.6 42
94 HPV31 E1 1554 1572 tgcactagatggcaaccct agggttgccatctagtgca 55.58 41
95 HPV31 E1 481 499 acacatagtgaacgagaga tctctcgttcactatgtgt 55.22 18
96 HPV31 E1 1504 1522 gatgatgctacaacgccat atggcgttgtagcatcatc 54.14 26
97 HPV31 E1 1534 1552 atagacaattacctacgaa ttcgtaggtaattgtctat 53.91 7
98 HPV31 E1 461 479 gttgtaatggtagtgacgg ccgtcactaccattacaac 53.43 19
99 HPV31 E1 648 666 gtgtgtagctgcgtttgga tccaaacgcagctacacac 52.99 13
100 HPV31 E1 914 932 gaatgtcaaacattagcga tcgctaatgtttgacattc 52.91 8
101 HPV31 E1 406 424 actgaagtggaaacgcagc gctgcgtttccacttcagt 52.73 26
102 HPV31 E1 1166 1184 gtagacattataaacgagc gctcgtttataatgtctac 52.73 38
103 HPV31 E1 462 480 ttgtaatggtagtgacggg cccgtcactaccattacaa 52.48 19
104 HPV31 E1 1167 1185 tagacattataaacgagca tgctcgtttataatgtcta 52.28 13
105 HPV31 E1 482 500 cacatagtgaacgagagaa ttctctcgttcactatgtg 52.21 35
106 HPV31 E1 479 497 ggacacatagtgaacgaga tctcgttcactatgtgtcc 52.19 31
107 HPV31 E1 644 662 attggtgtgtagctgcgtt aacgcagctacacaccaat 52.19 49
108 HPV31 E1 1553 1571 atgcactagatggcaaccc gggttgccatctagtgcat 51.86 49
109 HPV31 E1 643 661 gattggtgtgtagctgcgt acgcagctacacaccaatc 51.66 49
110 HPV31 E1 889 907 gcagcattatattggtaca tgtaccaatataatgctgc 51.65 41
111 HPV31 E1 1657 1675 gatgacagatggccatacc ggtatggccatctgtcatc 51.58 19
112 HPV31 E1 405 423 tactgaagtggaaacgcag ctgcgtttccacttcagta 51.32 23
113 HPV31 E1 465 483 taatggtagtgacgggaca tgtcccgtcactaccatta 51.25 16
114 HPV31 E1 259 277 cgaaagtatgtaggtagtc gactacctacatactttcg 51.16 46
115 HPV31 E1 918 936 gtcaaacattagcgatgta tacatcgctaatgtttgac 51.08 12
116 HPV31 E1 862 880 cagccacccaaattacgta tacgtaatttgggtggctg 50.96 16
117 HPV31 E1 464 482 gtaatggtagtgacgggac gtcccgtcactaccattac 50.81 30
118 HPV31 E1 597 615 tatggaactaattaggcca tggcctaattagttccata 50.79 43
119 HPV31 E1 89 107 acaacatttcagaggacga tcgtcctctgaaatgttgt 50.74 38
120 HPV31 E1 907 925 agaacaggaatgtcaaaca tgtttgacattcctgttct 50.71 49
121 HPV31 E1 90 108 caacatttcagaggacgaa ttcgtcctctgaaatgttg 50.58 31
122 HPV31 E1 1168 1186 agacattataaacgagcag ctgctcgtttataatgtct 50.51 22
123 HPV31 E1 209 227 ttcatgcacaggaagcgga tccgcttcctgtgcatgaa 50.48 38
124 HPV31 E1 1656 1674 ggatgacagatggccatac gtatggccatctgtcatcc 50.38 35
125 HPV31 E1 1506 1524 tgatgctacaacgccatgt acatggcgttgtagcatca 50.24 48
126 HPV31 E1 1533 1551 tatagacaattacctacga tcgtaggtaattgtctata 50.18 15
127 HPV31 E1 382 400 cttccagacagcgggtatg catacccgctgtctggaag 50.15 11
128 HPV33 E1 419 437 ctcagcagatggtacaaca tgttgtaccatctgctgag 58.85 31
129 HPV33 E1 516 534 tgagacaaatgtagatagc gctatctacatttgtctca 54.15 38
130 HPV33 E1 121 139 gatgacagtggcacggatt aatccgtgccactgtcatc 53.94 46
131 HPV33 E1 517 535 gagacaaatgtagatagct agctatctacatttgtctc 53.59 49
132 HPV33 E1 120 138 agatgacagtggcacggat atccgtgccactgtcatct 53.26 28
133 HPV33 E1 56 74 aggtagaagcagtcataga tctatgactgcttctacct 52.35 48
134 HPV33 E1 987 1005 acctgaatggatagataga tctatctatccattcaggt 52.3 38
135 HPV33 E1 382 400 ctagaagacagcggatatg catatccgctgtcttctag 52.17 10
136 HPV33 E1 378 396 tgagctagaagacagcgga tccgctgtcttctagctca 51.98 36
137 HPV33 E1 946 964 agaacagcaatgtcaaaca tgtttgacattgctgttct 51.52 49
138 HPV33 E1 122 140 atgacagtggcacggattt aaatccgtgccactgtcat 51.17 17
139 HPV33 E1 285 303 tgctgcggaggacgttgtt aacaacgtcctccgcagca 50.68 9
140 HPV33 E1 989 1007 ctgaatggatagatagact agtctatctatccattcag 50.03 39
141 HPV18 E1 962 980 gtagtgttgcagcactata tatagtgctgcaacactac 60.8 42
142 HPV18 E1 1874 1892 ccagattagatttgcacga tcgtgcaaatctaatctgg 59.07 19
143 HPV18 E1 1876 1894 agattagatttgcacgagg cctcgtgcaaatctaatct 58.78 35
144 HPV18 E1 200 218 aggcattgttccatgcgca tgcgcatggaacaatgcct 58.11 15
145 HPV18 E1 97 115 tcagatgacgaggacgaaa tttcgtcctcgtcatctga 57.87 23
146 HPV18 E1 1245 1263 gtgcaaacattataggcga tcgcctataatgtttgcac 57.83 23
147 HPV18 E1 199 217 caggcattgttccatgcgc gcgcatggaacaatgcctg 56.15 2
148 HPV18 E1 475 493 gtatgtagtggcggcagta tactgccgccactacatac 55.26 38
149 HPV18 E1 1582 1600 ttagatgatgcaacgacca tggtcgttgcatcatctaa 55.16 15
150 HPV18 E1 1331 1349 gagattggagaccaatagt actattggtctccaatctc 54.7 39
151 HPV18 E1 204 222 attgttccatgcgcaggag ctcctgcgcatggaacaat 54.14 18
152 HPV18 E1 471 489 caatgtatgtagtggcggc gccgccactacatacattg 54.05 47
153 HPV18 E1 531 549 cagcagtgtagacggtaca tgtaccgtctacactgctg 53.83 10
154 HPV18 E1 1899 1917 ggaagatgcagacaccgaa ttcggtgtctgcatcttcc 53.83 17
155 HPV18 E1 847 865 ttagccctgttgcgttaca tgtaacgcaacagggctaa 53.7 21
156 HPV18 E1 201 219 ggcattgttccatgcgcag ctgcgcatggaacaatgcc 53.58 6
157 HPV18 E1 202 220 gcattgttccatgcgcagg cctgcgcatggaacaatgc 53.09 30
158 HPV18 E1 1581 1599 gttagatgatgcaacgacc ggtcgttgcatcatctaac 53.07 10
159 HPV18 E1 631 649 caaggagctatgttagcag ctgctaacatagctccttg 53.04 47
160 HPV18 E1 1250 1268 aacattataggcgagccca tgggctcgcctataatgtt 53.02 20
161 HPV18 E1 1348 1366 gtgcaattcctgcgatacc ggtatcgcaggaattgcac 53.02 6
162 HPV18 E1 397 415 tcagatagtggctatggct agccatagccactatctga 52.84 49
163 HPV18 E1 1523 1541 ttgtgaattccactagtca tgactagtggaattcacaa 52.83 29
164 HPV18 E1 1126 1144 ctgacagatgaaagcgata tatcgctttcatctgtcag 52.78 49
165 HPV18 E1 714 732 cacgtgtacagattgggtt aacccaatctgtacacgtg 52.56 48
166 HPV18 E1 1247 1265 gcaaacattataggcgagc gctcgcctataatgtttgc 52.52 38
167 HPV18 E1 848 866 tagccctgttgcgttacaa ttgtaacgcaacagggcta 52.18 14
168 HPV18 E1 469 487 ggcaatgtatgtagtggcg cgccactacatacattgcc 52.13 40
169 HPV18 E1 844 862 atattagccctgttgcgtt aacgcaacagggctaatat 51.92 6
170 HPV18 E1 470 488 gcaatgtatgtagtggcgg ccgccactacatacattgc 51.82 30
171 HPV18 E1 717 735 gtgtacagattgggttaca tgtaacccaatctgtacac 51.82 45
172 HPV18 E1 1900 1918 gaagatgcagacaccgaag cttcggtgtctgcatcttc 51.76 21
173 HPV18 E1 477 495 atgtagtggcggcagtacg cgtactgccgccactacat 51.6 42
174 HPV18 E1 1875 1893 cagattagatttgcacgag ctcgtgcaaatctaatctg 51.49 27
175 HPV18 E1 1248 1266 caaacattataggcgagcc ggctcgcctataatgtttg 51.41 26
176 HPV18 E1 435 453 acagattcaggtaactaca tgtagttacctgaatctgt 51.23 48
177 HPV18 E1 473 491 atgtatgtagtggcggcag ctgccgccactacatacat 51.17 41
178 HPV18 E1 1346 1364 tagtgcaattcctgcgata tatcgcaggaattgcacta 51.15 15
179 HPV18 E1 1249 1267 aaacattataggcgagccc gggctcgcctataatgttt 50.82 22
180 HPV18 E1 1125 1143 gctgacagatgaaagcgat atcgctttcatctgtcagc 50.79 30
181 HPV18 E1 866 884 aatgtggtaagagtagact agtctactcttaccacatt 50.68 40
182 HPV18 E1 1903 1921 gatgcagacaccgaaggaa ttccttcggtgtctgcatc 50.51 19
183 HPV18 E1 578 596 atccacaatgtaccatagc gctatggtacattgtggat 50.46 39
184 HPV18 E1 846 864 attagccctgttgcgttac gtaacgcaacagggctaat 50.46 9
185 HPV18 E1 532 550 agcagtgtagacggtacaa ttgtaccgtctacactgct 50.41 7
186 HPV18 E1 1898 1916 aggaagatgcagacaccga tcggtgtctgcatcttcct 50.41 30
187 HPV18 E1 1129 1147 acagatgaaagcgatatgg ccatatcgctttcatctgt 50.36 7
188 HPV18 E1 1584 1602 agatgatgcaacgaccacg cgtggtcgttgcatcatct 50.33 12
189 HPV18 E1 1588 1606 gatgcaacgaccacgtgtt aacacgtggtcgttgcatc 50.21 36
190 HPV18 E1 845 863 tattagccctgttgcgtta taacgcaacagggctaata 50.07 7
191 HPV26 E1 1182 1200 ctgtgcaaccatgactaga tctagtcatggttgcacag 61.49 38
192 HPV26 E1 866 884 atgtgccagaaacgcaatt aattgcgtttctggcacat 56.18 8
193 HPV26 E1 505 523 gtggaagatatcgatgtag ctacatcgatatcttccac 55.32 14
194 HPV26 E1 793 811 gtactaatgctagtgcgct agcgcactagcattagtac 55.31 23
195 HPV26 E1 1183 1201 tgtgcaaccatgactagac gtctagtcatggttgcaca 54.94 38
196 HPV26 E1 976 994 acaccagaatggatagtac gtactatccattctggtgt 54.56 36
197 HPV26 E1 1865 1883 aacctttgccagcgtttaa ttaaacgctggcaaaggtt 54.35 19
198 HPV26 E1 53 71 cagtagaagctatagtgga tccactatagcttctactg 54.21 48
199 HPV26 E1 663 681 atgctgttcagattgggtg cacccaatctgaacagcat 54.17 48
200 HPV26 E1 979 997 ccagaatggatagtacgac gtcgtactatccattctgg 53.95 15
201 HPV26 E1 962 980 agacatatggagatacacc ggtgtatctccatatgtct 53.88 45
202 HPV26 E1 389 407 acagcgggtatggctatac gtatagccatacccgctgt 53.58 34
203 HPV26 E1 977 995 caccagaatggatagtacg cgtactatccattctggtg 53.51 36
204 HPV26 E1 980 998 cagaatggatagtacgaca tgtcgtactatccattctg 53.39 10
205 HPV26 E1 1864 1882 gaacctttgccagcgttta taaacgctggcaaaggttc 53.35 19
206 HPV26 E1 1211 1229 gagcacagaaacgatctat atagatcgtttctgtgctc 53.09 16
207 HPV26 E1 503 521 cagtggaagatatcgatgt acatcgatatcttccactg 53 21
208 HPV26 E1 197 215 cattgtttcaggcacaaca tgttgtgcctgaaacaatg 52.33 48
209 HPV26 E1 391 409 agcgggtatggctatactg cagtatagccatacccgct 52.14 47
210 HPV26 E1 1866 1884 acctttgccagcgtttaaa tttaaacgctggcaaaggt 52.06 26
211 HPV26 E1 1210 1228 agagcacagaaacgatcta tagatcgtttctgtgctct 51.91 26
212 HPV26 E1 864 882 aaatgtgccagaaacgcaa ttgcgtttctggcacattt 51.71 23
213 HPV26 E1 628 646 gcagaactagtacgggtgt acacccgtactagttctgc 51.69 18
214 HPV26 E1 1863 1881 agaacctttgccagcgttt aaacgctggcaaaggttct 51.41 39
215 HPV26 E1 978 996 accagaatggatagtacga tcgtactatccattctggt 51.34 3
216 HPV26 E1 390 408 cagcgggtatggctatact agtatagccatacccgctg 51.24 35
217 HPV26 E1 116 134 gtagtgatacagggtcgga tccgaccctgtatcactac 51.22 17
218 HPV26 E1 865 883 aatgtgccagaaacgcaat attgcgtttctggcacatt 51.18 26
219 HPV26 E1 1209 1227 aagagcacagaaacgatct agatcgtttctgtgctctt 50.99 7
220 HPV26 E1 794 812 tactaatgctagtgcgctt aagcgcactagcattagta 50.68 13
221 HPV26 E1 504 522 agtggaagatatcgatgta tacatcgatatcttccact 50.52 22
222 HPV26 E1 792 810 agtactaatgctagtgcgc gcgcactagcattagtact 50.36 5
223 HPV26 E1 173 191 atgcagaacaggaggtaac gttacctcctgttctgcat 50.06 45
224 HPV26 E1 867 885 tgtgccagaaacgcaatta taattgcgtttctggcaca 50.04 14