HPVomics

A therapeutic and epitome resource for Human Papillomaviruses

Efficient putative sgRNAs (CRISPR/Cas9 targets)

---

S.No.	HPV type	Target region	sgRNA seuences	PAM	Strand(F/R)	Start	End	GC (%)	Predicted effeciency (%)
1	HPV6	E1	GGAAGATGTCTATAAAACAA	TGG	F	1256	1275	30	70.19
2	HPV6	E1	GGGGGAGGAACATACAGAGG	CGG	F	516	535	60	68.38
3	HPV6	E1	GTATGATAATGACATATGCG	AGG	F	1095	1114	35	54.98
4	HPV6	E1	GGCATTGTTTAACAGGCAGG	AGG	F	192	211	50	53.32
5	HPV6	E1	GGACAGTGGGTATGACATGG	TGG	F	123	142	55	50.94
6	HPV6	E1	ATTCAGGTACAGAAAATGAG	GGG	F	11	30	35	50.26
7	HPV6	E1	GTATCCATATATATCCAACA	TGG	R	347	366	30	49.58
8	HPV6	E1	GGAACGCAGGTAGAGAAACA	TGG	F	439	458	50	47.66
9	HPV6	E1	AGAGGGGGAGGAACATACAG	AGG	F	513	532	55	47.58
10	HPV6	E1	GGACACAGGAAGGGACATAG	AGG	F	495	514	55	47.55
11	HPV6	E1	GAGCCACCAAAAATACAAAG	TGG	F	925	944	40	44.25
12	HPV6	E1	AGTTTAATAAGCTTTCTAGG	AGG	F	1468	1487	30	44.23
13	HPV6	E1	GCGACGGCTGTTTCAAACCA	GGG	F	369	388	55	44.17
14	HPV6	E1	TCCTATAAACACTATAGCCG	AGG	F	279	298	40	44.1
15	HPV6	E1	GGAGGACAGTGGGTATGACA	TGG	F	120	139	55	42.11
16	HPV6	E1	TACAATGGCTAACAAATGCA	TGG	F	794	813	35	41.54
17	HPV6	E1	GTGTTTATAGGACTAACATA	TGG	R	1661	1680	30	41.33
18	HPV6	E1	GCTATAGTGCAACACCCAAC	AGG	F	64	83	50	41.01
19	HPV6	E1	GGTTCTAAAATAGAAGGCAC	AGG	F	1291	1310	40	40.63
20	HPV6	E1	GTTTATATGCACATATACAA	TGG	F	779	798	25	40.38
21	HPV6	E1	TATACATCATAGCATATCAG	AGG	F	729	748	30	40.24
22	HPV6	E1	GGTCCTGCACAGTCGCATAA	TGG	R	1707	1726	55	40.16
23	HPV11	E1	GGGGGTGGAACATAGAGAGG	CGG	F	516	535	60	74.61
24	HPV11	E1	GGAGGGACATAGAGGGTGAG	GGG	F	497	516	60	56.99
25	HPV11	E1	GGCATTGTTTAATAGGCAGG	AGG	F	192	211	45	54.42
26	HPV11	E1	GGACACAGGGAGGGACATAG	AGG	F	489	508	60	54.07
27	HPV11	E1	GCATTTGAATATGCACAGCG	TGG	F	1129	1148	45	53.59
28	HPV11	E1	GGACAGTGGGTATGACATGG	TGG	F	123	142	55	50.94
29	HPV11	E1	AAATAAGAGCAGATGTACCG	TGG	F	852	871	40	50.77
30	HPV11	E1	GGACATAGAGGGTGAGGGGG	TGG	F	501	520	65	50.37
31	HPV11	E1	ATTCAGGTACAGAAAATGAG	GGG	F	11	30	35	50.26
32	HPV11	E1	GAGCCTCCTAAAATACAAAG	TGG	F	925	944	40	48.35
33	HPV11	E1	GTATCCATATATGTCCAACA	TGG	R	347	366	35	47.99
34	HPV11	E1	AGATGAGGAAGAGGAGGTGG	AGG	F	102	121	55	45.27
35	HPV11	E1	ATAGAACCACATGTGCCGAT	TGG	F	689	708	45	45.2
36	HPV11	E1	CACGACTTCCCAGTGTCAGG	TGG	R	494	513	60	44.5
37	HPV11	E1	CATTGAGGATTCAGAGGACG	AGG	F	1866	1885	50	43.12
38	HPV11	E1	GGGAGGGACATAGAGGGTGA	GGG	F	496	515	60	42.42
39	HPV11	E1	GGAGGACAGTGGGTATGACA	TGG	F	120	139	55	42.11
40	HPV11	E1	TTTGATGTAACCAGTAGCGG	TGG	R	248	267	45	42
41	HPV11	E1	TTAAACAATGGATTAAGTAT	AGG	F	1268	1287	20	40.64
42	HPV11	E1	GTTTATATGCACATATACAA	TGG	F	779	798	25	40.38
43	HPV11	E1	AGAAGATGAGGAAGAGGAGG	TGG	F	99	118	50	40.37
44	HPV11	E1	GTACAGAAAATGAGGGGTCG	GGG	F	17	36	50	40.1
45	HPV40	E1	GGTTAATCCCACCATAGCCG	AGG	F	729	748	55	66.33
46	HPV40	E1	GGCAGACTCTCCAGGTACAG	AGG	F	3	22	60	64.62
47	HPV40	E1	GGACCGGAAGATACCGTGGG	GGG	F	469	488	65	56.9
48	HPV40	E1	TGGACGTTAACAGTAACGGA	GGG	R	246	265	45	56.74
49	HPV40	E1	TGTAGTGGATAAACAAACGG	GGG	F	66	85	40	56.32
50	HPV40	E1	ATAAATCCACGTGTACCGAT	TGG	F	689	708	40	53.06
51	HPV40	E1	TGGCGGACCGGAAGATACCG	TGG	F	465	484	65	52.11
52	HPV40	E1	ATACACCCAATCGGTACACG	TGG	R	1228	1247	50	51.59
53	HPV40	E1	TTATGCACAAAGAGCAGACG	TGG	F	1137	1156	45	50.52
54	HPV40	E1	AGACAGGTAGAGACAGAACA	TGG	F	445	464	45	49.8
55	HPV40	E1	GCGGCCAAAAGGCTAAACGG	CGG	F	359	378	60	49.14
56	HPV40	E1	CATGCAATACGGCTTGGCGG	CGG	F	340	359	60	47.05
57	HPV40	E1	GGGGGGCTGGGTGCTCAGGA	TGG	F	29	48	75	46.51
58	HPV40	E1	GGCGGACCGGAAGATACCGT	GGG	F	466	485	65	45.69
59	HPV40	E1	GTTGTGTGCGCGGACTACAG	TGG	R	1362	1381	60	43.55
60	HPV40	E1	GGCGCATGTCAATGGCTGAG	TGG	F	1256	1275	60	42.8
61	HPV40	E1	CCATTTGCATGACGTCCATT	GGG	R	1129	1148	45	42.57
62	HPV40	E1	GCGGACCGGAAGATACCGTG	GGG	F	467	486	65	42.04
63	HPV40	E1	GGATGCTGTATCGGAAGATG	AGG	F	87	106	50	41.62
64	HPV40	E1	GGTATATGGATACACACATG	AGG	F	1589	1608	40	41.07
65	HPV40	E1	GGGCACTTAATTACTGCTAA	CGG	R	266	285	40	40.38
66	HPV42	E1	GGCGGATGATACAGGTACAG	AGG	F	3	22	55	56.94
67	HPV42	E1	GGATGATACAGGTACAGAGG	AGG	F	6	25	50	56.18
68	HPV42	E1	GTATGTTTAATAATTTACTA	AGG	R	1050	1069	15	54.48
69	HPV42	E1	ACACAGGTAGAACACGGACA	TGG	F	439	458	50	49.88
70	HPV42	E1	GGGGTGCAGGAAAATGAAGA	AGG	F	511	530	50	49.64
71	HPV42	E1	GCAGCCACACTTTGTAACCG	AGG	R	1001	1020	55	49.45
72	HPV42	E1	GGCGGTTTAACGCTATGTCG	GGG	F	331	350	55	48.26
73	HPV42	E1	CTACAAGTACGCCTACAACA	AGG	F	539	558	45	47.97
74	HPV42	E1	TTAATCATAGTATTGCAGAA	GGG	F	710	729	25	47.36
75	HPV42	E1	ATGGGACTATGGGTAACGGG	GGG	F	470	489	55	47.03
76	HPV42	E1	TACAATGGCTAACCTGTACG	TGG	F	773	792	45	44.69
77	HPV42	E1	GGGCAGTGGGTAGTGAACTT	GGG	F	491	510	55	42.93
78	HPV42	E1	CATGGGACTATGGGTAACGG	GGG	F	469	488	55	42.85
79	HPV42	E1	TTGATGTTATAAGTAATGGT	GGG	R	252	271	25	42.53
80	HPV42	E1	ACAATGGCTAACCTGTACGT	GGG	F	774	793	45	41.96
81	HPV42	E1	GTATTTGATGTTATAAGTAA	TGG	R	248	267	20	40.89
82	HPV42	E1	ACATGGGACTATGGGTAACG	GGG	F	468	487	50	40.39
83	HPV43	E1	GGAAGATGAGATTGAGGACG	AGG	F	99	118	50	72.68
84	HPV43	E1	GGAGTGGATTAAACATAGAG	GGG	F	1296	1315	40	63.09
85	HPV43	E1	GGAAGTGTAATGATGGAGAC	TGG	F	1319	1338	45	61.72
86	HPV43	E1	GGGCCAATAAAGGGTGTGGG	AGG	F	488	507	60	58.72
87	HPV43	E1	GGTGACCTGTAGATGGGGAA	TGG	F	825	844	55	57.42
88	HPV43	E1	ATATGATAACGGATATACAG	AGG	F	1119	1138	30	55.31
89	HPV43	E1	GGAAGCTGTAGAGGTTGTAG	AGG	F	528	547	50	54
90	HPV43	E1	CCCTATACCTACATACCCAG	TGG	F	803	822	50	50.56
91	HPV43	E1	AGTGGATTAAACATAGAGGG	GGG	F	1298	1317	40	46.24
92	HPV43	E1	CTTAGAACTGGACACTGCAG	AGG	F	1881	1900	50	45.32
93	HPV43	E1	GGCTGATAAACAAGGTACAG	AGG	F	3	22	45	44.84
94	HPV43	E1	TGTTTCACGTAACAGAGCAG	CGG	F	383	402	45	44.24
95	HPV43	E1	GGCCAATAAAGGGTGTGGGA	GGG	F	489	508	55	43.92
96	HPV43	E1	CATGCAATAAAGATTGGAGG	CGG	F	340	359	40	41.61
97	HPV44	E1	CAATAGTTCTAGTACCCGCG	TGG	R	1354	1373	50	69.84
98	HPV44	E1	GGATGAGGATGAGGCAGTGG	AGG	F	96	115	60	61.68
99	HPV44	E1	GGCAGTGGAGGATAGTGGGT	TGG	F	108	127	60	61.21
100	HPV44	E1	GGACAAGGAAGGGACACAGA	GGG	F	475	494	55	58.41
101	HPV44	E1	GGGGGTGGAACAGGTGGAAA	CGG	F	495	514	60	50.2
102	HPV44	E1	GGATAGTGGGTTGGATATGG	TGG	F	117	136	50	49.62
103	HPV44	E1	GGCATTGTTAAACGAGCAGG	AGG	F	186	205	50	49.37
104	HPV44	E1	GGAGGCGGATGCTCATTATG	CGG	F	204	223	55	48.38
105	HPV44	E1	AACAGCACACCGGGACCACG	CGG	F	542	561	65	47.34
106	HPV44	E1	TAAACCTTACTAATGCCAGT	AGG	R	1104	1123	35	46.93
107	HPV44	E1	ATACAAATATTTATGTAGCA	GGG	F	1710	1729	20	45.9
108	HPV44	E1	GGCAAACCATTGTAGAACAT	GGG	F	1010	1029	40	45.86
109	HPV44	E1	AATGTTATAGCGTCCAGCCG	TGG	R	1595	1614	50	45.48
110	HPV44	E1	GTAAGTTTAAGGATTGCTAT	GGG	F	611	630	30	44.25
111	HPV44	E1	GGCGAACCGGAAGATTGTGG	GGG	F	448	467	60	43.79
112	HPV44	E1	GGTGCACCATAGTGTGTCAG	AGG	F	711	730	55	43.25
113	HPV44	E1	GAACCTCCTAAAATACAAAG	CGG	F	907	926	35	42.7
114	HPV44	E1	AGAGGATGAGGATGAGGCAG	TGG	F	93	112	55	41.05
115	HPV44	E1	GGCTGACAATACAGGTACAG	AGG	F	3	22	50	40.44
116	HPV54	E1	GCTGAACGACAACGATAACG	AGG	F	1812	1831	50	61.63
117	HPV54	E1	GGGCTATATCCCTAGGACGG	CGG	F	335	354	60	60.4
118	HPV54	E1	GGATAACCAAGGTACAGAGG	AGG	F	6	25	50	59.38
119	HPV54	E1	GGGATATAGCCCCTAGCCGG	GGG	R	1557	1576	65	55.82
120	HPV54	E1	GGGTTTCCATTACTATCAAA	TGG	R	155	174	35	53.8
121	HPV54	E1	CGGTGGAGGTAAATACCGAG	GGG	F	431	450	55	50.41
122	HPV54	E1	AATTGTAGAACGTAAAACAG	GGG	F	66	85	30	48.99
123	HPV54	E1	TGCGGTGGAGGTAAATACCG	AGG	F	429	448	55	48.43
124	HPV54	E1	GGTCAGCCAAAGCCAAACGA	CGG	F	356	375	55	48.14
125	HPV54	E1	ATATGGCCATACAAACAATG	TGG	R	1163	1182	35	45.96
126	HPV54	E1	GGCGGATAACCAAGGTACAG	AGG	F	3	22	55	45.58
127	HPV54	E1	GCAATTGTAGAACGTAAAAC	AGG	F	64	83	35	45.37
128	HPV54	E1	AGGGATATAGCCCCTAGCCG	GGG	R	1556	1575	60	44.69
129	HPV54	E1	ACAAAACAGTGTGTACCGAT	TGG	F	635	654	40	43.14
130	HPV54	E1	TGTTTTCTATCAAAGCACAT	AGG	R	302	321	30	43.07
131	HPV54	E1	TTGTCTGGCCAGCCATTCCG	GGG	R	925	944	60	42.83
132	HPV54	E1	ATATCCAATGGCTAACATGT	AGG	F	737	756	35	41.75
133	HPV54	E1	ACATCGTTGTGATTTAGTAG	AGG	F	1230	1249	35	41.46
134	HPV54	E1	ATGCTAGTACAGACGACAGA	TGG	F	1655	1674	45	40.16
135	HPV61	E1	GCACTTCCTGCCCATCCCCG	GGG	R	1758	1777	70	79.98
136	HPV61	E1	GGGATCTGATCAACAGGAGG	AGG	F	1860	1879	55	69.47
137	HPV61	E1	GGGGGGGGACGGAGAGGCCG	AGG	F	510	529	85	69.11
138	HPV61	E1	GACGCCATACGGATACACCG	GGG	F	337	356	60	68.29
139	HPV61	E1	GGGATGCGCAACATGAGGGG	GGG	F	452	471	65	66.39
140	HPV61	E1	GTATCCGTATGGCGTCCAGC	CGG	R	1608	1627	60	64.39
141	HPV61	E1	GGATGCGCAACATGAGGGGG	GGG	F	453	472	65	58.6
142	HPV61	E1	GGAATCCGTGCAGGAAGCAG	AGG	F	477	496	60	57.59
143	HPV61	E1	GGAGGAGGAGGAGGAGGATG	AGG	F	1878	1897	65	56.52
144	HPV61	E1	GGGTCCCCATTACTGTTTAG	TGG	R	164	183	50	55.41
145	HPV61	E1	GGGGGATGCGCAACATGAGG	GGG	F	450	469	65	54.93
146	HPV61	E1	GGAAGCAGAGGAGGAGCGTG	GGG	F	489	508	65	53.59
147	HPV61	E1	GGGGATGCGCAACATGAGGG	GGG	F	451	470	65	53.46
148	HPV61	E1	ATATTGGTATAGAACAGCCA	TGG	F	954	973	35	53.44
149	HPV61	E1	AGAGGGATCTGATCAACAGG	AGG	F	1857	1876	50	53.22
150	HPV61	E1	ACAAATACAGACATGCCAGT	GGG	F	789	808	40	52.62
151	HPV61	E1	GATTACACATAGAGGCCGCA	AGG	F	1272	1291	50	50.25
152	HPV61	E1	CATAGATACAAGGCGCCCCG	GGG	F	165	184	60	50.16
153	HPV61	E1	GGTGCGCTTCTAATCTTTGG	TGG	R	1016	1035	50	50.07
154	HPV61	E1	GGGAAAACTGTTAAACATAC	CGG	F	879	898	35	49.29
155	HPV61	E1	TTAATATTACCATTCCCCAC	TGG	R	1134	1153	35	47.17
156	HPV61	E1	GGAAACAGTAGCACACAGCA	TGG	F	858	877	50	47.06
157	HPV61	E1	GGATACACCGGGGACAGGAC	AGG	F	347	366	65	45.82
158	HPV61	E1	GTATTGCCAGCACTGATAGG	TGG	R	370	389	50	45.24
159	HPV61	E1	CCACCCCCCTGCGCGTTCCG	CGG	R	1894	1913	80	44.94
160	HPV61	E1	AAATGAGGACCCAAATGCGG	CGG	F	1146	1165	50	44.52
161	HPV61	E1	CATCAGAAAGTCAGGTACCG	GGG	F	431	450	50	44.28
162	HPV61	E1	GGATGACGCTGCAACGGTGC	AGG	F	234	253	65	44.15
163	HPV61	E1	GGGAAATGAGGACCCAAATG	CGG	F	1143	1162	50	43.14
164	HPV61	E1	GTGGTTTCTGGTAGAAGCCG	TGG	F	63	82	55	42.9
165	HPV61	E1	GCAGGCGGCAGACATATTAG	AGG	F	564	583	55	42.29
166	HPV61	E1	ATACCTGCACAGTAGAATAG	TGG	F	1728	1747	40	42.29
167	HPV61	E1	GGACAATAGCATTGACACAG	GGG	F	126	145	45	42.15
168	HPV61	E1	AGGACAATAGCATTGACACA	GGG	F	125	144	40	41.38
169	HPV61	E1	TTACAGCCTCTGCCACAGCA	TGG	R	1209	1228	55	41.32
170	HPV61	E1	CGAGGCCGCGGAACGCGCAG	GGG	F	39	58	80	40.61
171	HPV61	E1	TTAAACGTAGGATCCTCTAG	TGG	R	233	252	40	40.6
172	HPV61	E1	CAGGAAGCAGAGGAGGAGCG	TGG	F	487	506	65	40.05
173	HPV70	E1	GGTACTGTATAATATGCAAG	AGG	F	201	220	35	62.95
174	HPV70	E1	GGCAATAGTAGATAAACAAA	CGG	F	63	82	30	57.17
175	HPV70	E1	GGAAAAAACAGGATAACAGT	AGG	F	856	875	35	53.19
176	HPV70	E1	GCAATAGTAGATAAACAAAC	GGG	F	64	83	30	50.37
177	HPV70	E1	GGAAGTGGAAACAGCTGAAG	TGG	F	420	439	50	49.38
178	HPV70	E1	GATGTGATAAATGTGACGAT	GGG	F	1292	1311	35	49.2
179	HPV70	E1	GCAATTTCTAAGGTATCAAG	GGG	F	1335	1354	35	46.94
180	HPV70	E1	ATAATATGCAAGAGGCCCAA	AGG	F	209	228	40	45.01
181	HPV70	E1	GTAAATCCCACCATAGCAGA	AGG	F	733	752	45	44.89
182	HPV70	E1	AACAGGATAACAGTAGGCAA	AGG	F	862	881	40	42.71
183	HPV70	E1	TGTTCCCTATGTACGCCTGG	CGG	R	1634	1653	55	42.63
184	HPV70	E1	GGGGATGGGTCGGGATGTAA	CGG	F	25	44	60	41.97
185	HPV70	E1	GTGTATTCAGTACCAGACAG	CGG	F	385	404	45	41.69
186	HPV70	E1	TTATTATTGATTGTGTACAC	TGG	R	134	153	25	41.56
187	HPV70	E1	GGGGAAGAGGAAGGGGAAAA	TGG	F	469	488	55	41.47
188	HPV72	E1	GGACGAGGATGCGAATCGCG	CGG	F	36	55	65	76.5
189	HPV72	E1	TTATGCTTATGGCGTCCAGT	CGG	R	1602	1621	45	68.91
190	HPV72	E1	GACGCCATAAGCATAAACCG	GGG	F	337	356	50	68.26
191	HPV72	E1	GGGACCTGACGAACAGGAGG	AGG	F	1860	1879	65	63.9
192	HPV72	E1	GGAAGCGGAAGAGGAGCGTG	TGG	F	492	511	65	62.31
193	HPV72	E1	GGGTACACAGCATACAAAGG	GGG	F	453	472	50	60.4
194	HPV72	E1	GGGGTACACAGCATACAAAG	GGG	F	452	471	50	57.08
195	HPV72	E1	ATACTGGTATAGAACAGCAA	TGG	F	954	973	35	55.27
196	HPV72	E1	GGGGGTACACAGCATACAAA	GGG	F	451	470	50	53.5
197	HPV72	E1	GGGGGGTACACAGCATACAA	AGG	F	450	469	55	52.33
198	HPV72	E1	ACTGCGAAGGTACTGAACGG	GGG	F	8	27	55	52.1
199	HPV72	E1	GCCTTTCTACCTTAGTACAG	TGG	F	1064	1083	45	51.91
200	HPV72	E1	GGAAGAGGAGCGTGTGGGGG	GGG	F	498	517	70	51.21
201	HPV72	E1	ACTGGACTCTTGGTACCCTG	TGG	R	1837	1856	55	50.66
202	HPV72	E1	CCAGAAAGCCAGGTATCGGG	GGG	F	433	452	60	50.65
203	HPV72	E1	GGTATATCATGCAGTGGCAG	AGG	F	723	742	50	50.02
204	HPV72	E1	AGGCTGTTTGACCAAGACAG	TGG	F	379	398	50	48.72
205	HPV72	E1	TGACACAGTGGATAGCACAT	AGG	F	1262	1281	45	47.92
206	HPV72	E1	TTATAGACACAAGATCCTTA	GGG	F	164	183	30	45.35
207	HPV72	E1	GGATCACCGTTGCTTTTTAA	TGG	R	158	177	40	45.09
208	HPV72	E1	GGTATAAATGTGGCAAGAGT	AGG	F	836	855	40	44.59
209	HPV72	E1	GGAAATGGCAGCGAGGTGTA	CGG	F	976	995	55	43.72
210	HPV72	E1	GGTCCACTTCTAATTTTTGG	TGG	R	1010	1029	40	42.74
211	HPV72	E1	AGAGGGACCTGACGAACAGG	AGG	F	1857	1876	60	42.55
212	HPV72	E1	CCATAGTGGAGCAAACCACA	GGG	F	80	99	50	42.34
213	HPV72	E1	GCATAAACCGGGGACACGAC	AGG	F	347	366	60	41.67
214	HPV72	E1	GGTACACAGCATACAAAGGG	GGG	F	454	473	50	40.33
215	HPV72	E1	GGATGACGCTGCAACCGTGC	AGG	F	234	253	65	40.19
216	HPV72	E1	AAGTGCCCATTAAAAAGCAA	CGG	F	1768	1787	35	40.12
217	HPV81	E1	GGAGGAGGAGGAGGAGGAGG	AGG	F	1869	1888	70	69.05
218	HPV81	E1	GGGAGGGTGGTTTATGGTGG	AGG	F	57	76	60	64.02
219	HPV81	E1	ACTTGATTCCTGATACCCTG	TGG	R	1837	1856	45	59.24
220	HPV81	E1	GGCTGATGTGGAAGGTACAG	AGG	F	3	22	55	58.8
221	HPV81	E1	ATACTGGTATAAAACAGCAA	TGG	F	951	970	30	57.88
222	HPV81	E1	GCTGTTGTAGAAAAAACCAC	AGG	F	79	98	40	57.74
223	HPV81	E1	GACGCCATAAGCCTAGACCG	GGG	F	337	356	60	56.37
224	HPV81	E1	GGAAATGCAAGTGAAACAGT	AGG	F	973	992	40	55.74
225	HPV81	E1	GGAGGAAGTGCGGGGGGGGG	GGG	F	495	514	80	55.71
226	HPV81	E1	GGGGGCACGAAAGGGCCCGA	AGG	F	356	375	75	52.35
227	HPV81	E1	GGCGGAGGCCGCGGACAGGG	CGG	F	36	55	85	52.32
228	HPV81	E1	GGGATTGGAAACCAATTGTA	AGG	F	1304	1323	40	51.08
229	HPV81	E1	ATATGCGCATAATGGCACAG	TGG	R	1169	1188	45	50.71
230	HPV81	E1	CATCCGAAGGACAGGTACCG	GGG	F	431	450	60	49.83
231	HPV81	E1	GTAAGTTTAAGGAATTGTAT	GGG	F	620	639	25	48.45
232	HPV81	E1	GATAGCACATAGAAGCCTAA	AGG	F	1269	1288	40	47.32
233	HPV81	E1	TTAGTTGTAATCAGTAATGG	GGG	R	260	279	30	46.82
234	HPV81	E1	GGAAGTGCCGGAGGAAGTGC	GGG	F	486	505	65	46.42
235	HPV81	E1	GTATCTATGTACACCCAACA	TGG	R	359	378	40	44.9
236	HPV81	E1	GGTTGTTTGACCAGGACAGT	GGG	F	380	399	50	44.86
237	HPV81	E1	CTGTTGTAGAAAAAACCACA	GGG	F	80	99	35	44.5
238	HPV81	E1	GGTTAATCCAGAGGAGGAGG	AGG	F	1857	1876	55	44.01
239	HPV81	E1	GGGTCCCCATTGTCATCTAA	CGG	R	161	180	50	42.94
240	HPV81	E1	TGGCAAAAGTAGGGACACAG	TGG	F	843	862	50	41.46
241	HPV81	E1	GAAGTGCCGGAGGAAGTGCG	GGG	F	487	506	65	41.43
242	HPV81	E1	TCATAGATACACGATATCCA	GGG	F	164	183	35	40.8
243	HPV81	E1	GGCGTGCTTTTAATTTTTGG	TGG	R	1013	1032	40	40.35